三地联合溯源！华大智造为构建粤东公共卫生防护网提供工具支撑

日前,华大智造为汕头市、揭阳市及潮州市粤东三地疾控开放了ATOPlex DENV1-4靶向测序流程的先行先试,助力完成了登革病毒的三地联合溯源研究。华大智造为此次联合溯源研究提供了自主研发的全流程工具,不仅推动了粤东区域公共卫生防护网的进一步构建,也积累了可借鉴、可推广的经验和模式。

登革热是一种由登革病毒引起的虫媒传染病,感染的伊蚊为主要的传播媒介。随着全球贸易发展和旅游业的逐步复苏,人口的流动加剧了登革热疫情传播的风险。在我国,每年的6~10月会进入登革热的易发季节。广东地区的气候适宜白纹伊蚊的生长,地区经济发达,人口密度较大,因而广东省各地对登革热传播的防控工作高度重视。今年8月份以来,广东省内各地疾控单位相继调整对登革热的防控等级,并发布公告,提醒广大群众注意防蚊灭蚊。

华大智造基于自主研发的ATOPlex多重PCR扩增技术平台,开发了针对登革病毒的样本到报告的全流程产品组合,能够覆盖DENV1-DENV4四种血清型,支持检测血清、环境等多种样本;自主开发的软件分析流程包含了变异检测以及株系分型等功能模块,为科研工作者和公卫防控工作者提供了强有力的工具支撑。

华大智造ATOPlex DENV1-4靶向扩增建库试剂盒

01助力首家先行先试

华大智造&汕头疾控“分子生物学前沿技术粤东区域培训基地”(以下简称“粤东培训基地”)今年5月在汕头市正式揭牌成立,旨在共同促进粤东区域生物安全体系建设,推动病原检测技术培养方案落地。为了提升登革热防控能力,华大智造为粤东培训基地提供了可实现登革病毒快速鉴定及溯源的ATOPlex  DENV1-4靶向测序流程。9月中旬,汕头市疾控中心在粤东培训基地基于MGISEQ-200平台对10例感染病例样本进行ATOPlex DENV1-4靶向测序,经后续分析均获得了高质量的基因组和准确的鉴定分型,其中9例鉴定为DENV-1型,1例样本为DENV-2型。

汕头疾控工作人员基于华大智造设备操作登革病毒溯源

02辐射粤东联合溯源

为了对粤东地区登革热感染病例进行更全面的溯源研究,在汕头疾控之后,揭阳市和潮州市的疾控中心也立即响应,先后在基于MGISEQ-200平台的ATOPlex DENV1-4靶向测序流程上完成测序。10月19日,潮州疾控完成8例登革热感染病例样本的测序及分析,分析报告显示6例鉴定为2型,2例为1型,同时与潮州疾控自主完成的多平台测序结果做比对,得到的结果均一致,且智造方案包含的分析报告能够直观地显示样本的变异、测序整体覆盖度、病毒的相对定量浓度等信息。10月31日,揭阳疾控完成8例登革热感染病例样本的测序及分析,8例均为2型。三市病例样本的鉴定结果说明,粤东三地该轮出现的登革热感染病例可能为不同来源。此次粤东三地针对登革热感染病例的联合溯源研究,为公卫防控研究人员进一步判断传播模式提供了依据,帮助疾控中心迅速响应并展开对蚊媒的监控和扑灭行动。

潮州疾控工作人员基于华大智造设备操作登革病毒溯源

揭阳疾控工作人员基于华大智造设备操作登革病毒溯源

汕头-揭阳-潮州三市形成粤东公共卫生防护网

03持续发力助力公卫防控

华大智造自主研发的ATOPlex多重PCR建库试剂盒定制化平台,能够在一管中实现超高重扩增,适用于多种痕量样本的检测,其具有灵敏度高,能够相对定量等优势,在病原微生物捕获测序中有广泛的应用。华大智造还将陆续推出针对结核分枝杆菌、HIV的ATOPlex建库产品,不断拓展DNBSEQ测序技术在病原微生物研究和传染病防控领域的应用场景。

在公共卫生领域,华大智造已形成病原微生物宏基因组测序、靶向测序、全基因组测序等应用场景的全流程产品组合。未来,秉承“创新智造引领生命科技”的理念,华大智造将持续研发创新,为公共卫生事件的监测和预警提供更自动、更便捷、更高效的自主核心工具。